طب الجهاز الهضمي هو فرع من فروع الطب الباطني، يُعنى بأمراض المريء والمعدة والأمعاء الدقيقة والغليظة والشرج والكبد والمرارة والقنوات الصفراوية والبنكرياس والصفاق.

يشمل طب الجهاز الهضمي التشخيص والعلاج الطبي والتنظيري لأمراض هذه الأعضاء، مثل الارتجاع المريئي، وسرطان المريء، وفتق المعدة، والقرحة، والتهاب المعدة، وسرطان المعدة، واضطرابات امتصاص الجهاز الهضمي (داء السيلياك، إلخ)، والقولون التشنجي (متلازمة القولون العصبي)، وأمراض الأمعاء الالتهابية (القولون التقرحي، ومرض كرون)، وسرطانات الأمعاء، والبواسير، واليرقان (التهاب الكبد ب أو ج)، وأمراض الكبد مثل تليف الكبد (الكبد الدهني)، وحصوات المرارة والتهابها، وأمراض البنكرياس.

تُعد تنظيرات المريء والمعدة والاثني عشر من الإجراءات التنظيرية الشائعة الاستخدام في تشخيص وعلاج أمراض الجهاز الهضمي. تنظير القولون.